BIO-INFORMATIKA

Sebelumnya apa itu bioinformatika ?

Bioinformatika terdiri dari kata biologi dan informatika

Biologi yang berarti ilmu yang memperlajari mahkluk hidup

dan informatika yang berarti berkaitan dengan teknologi berupa komputer dan informasi

Bioinformatik merupakan suatu studi interdisiplin yang mempelajari analisis kuantitatif dari informasi yang berkaitan dengan makromolekul biologi, ditunjang oleh perangkat komputer. Komputer berperan untuk menyimpan, mendapatkan kembali, memanipulasi,dan mendistribusikan informasi yang berkaitan dengan makromolekul biologi, seperti DNA, RNA dan protein. Peranan komputer sangat diperlukan karena kebanyakan analisis data genomik memerlukan pengulangan tinggi ataupun fungsi matematika yang kompleks(Attwood, dan Parry,1999).

BIOLOGI

KOMPUTER

TEHNOLOGI INFORMASI

Jadi hubungan antara ketiga hal tersebut yang saling terkait, sehingga menciptakan bioinformatika. Ilmu biologi mempunyai kekurangan tentang data yang kurang bisa diprediksi dan tingkat kesalahan yang tinggi, sehingga dengan adanya komputer dan tehnologi informasi kekurangan itu apat ditutup. Hasilnya adalah keakuratan data dan mampu mencegah hal-hal yang tidak diinginkan karena data dapat diprediksi. Wujud nyatanya adalah dengan dibuatnya software-software untuk mengalisis data biologi.

Selain Software-software, data biologi juga di simapn di sebuah situs. Sudah menjadi kesepakatan bersama bahwa sebagian besar data-data sekuen biologi bersifat terbuka dan dapat diakses oleh semua kalangan. Data-data sekuens tersebut dihimpun dalam suatu database yang dapat diakses secara online. Saat ini, terdapat tiga situs penyedia databse sekuen molekular yang tergabung dalam INSDC (International Nucleotide Sequence Database Collaboration), yaitu GenBank pada NCBI (National Center Biotechnology Information-USA), EMBL-Bank (European Molecular Biology Laboratory) pada EBI (Europe Bioinformatic Institute-England), dan DDBJ (DNA Datat Bank of Japan) pada CIB (Center for Information Biology-Jepang). Ketiga situs tersebut bertukar data setiap hari sehingga database ketiganya relatif serupa. Perbedaan ketiganya hanya format tampilan data.

Tampilan Situs NCBI (www.ncbi.nlm.nih.gov)

Tampilan situs EBI (www.ebi.ac.uk)

Tampilan Situs DDBJ (www.ddbj.nig.ac.jp)

Khusus untuk sekuen protein, database dapat diakses melalui situs Expasy (Expert protein analysis). Situs ini menyediakan berbagai macam program untuk mendapatkan informasi mengenai protein, salah satunya adalah SWISS-PROT protein sequence database. SWISS-PROT sendiri didukung oleh SIB (Swiss Institute of Bioinformatic) dan EBI (Europe Bioinformatic Institute). Expasy juga menyediakan tautan ke GenBank, EMBL, dan DDBJ.

Tampilan Situs Expasy (www.expasy.org)